Pekan ke-1 Oktober 2023

3 Oktober 2023

• Gladi bersih IC3INA, yg tanggal 2 gak bisa ikut karena gak ada sinyal

4-5 Oktober 2023

• Hari 1: https://www.youtube.com/watch?v=dtXsNJpj8P8
• Hari 2: https://www.youtube.com/watch?v=wPPfipIwQWE

6 Oktober 2023

• Menyelesaikan copyright dan sign artikel melalui IEEE Pdf Express

Pekan ke-4 September 2023

26 September 2023

• Sharing session pekanan PRSDI oleh KR e-gov
• Diskusi dengan mas Heru di PRTKMMN Pasar Jumat

27 September 2023

• Diskusi WG artefak dengan progres
  • Finalisasi kelompok klasifikasi
  • Finalisasi definisi dan hirarki terminology, misal:
    • Jika 1 artikel masuk kelompok No-requirement dan Requirement sekaligus, maka dimasukkan dalam kelompok Requirement yang sifatnya lebih spesifik
  • TODO:
    • Memaparkan metode transformasi dataset ke dalam klasifikasi yang baru (PIC: AAW)
• Diskusi WG biodiversity (anggotanya sama saja) dengan progres
  • Disepakati bentuk dataset sbb.:
    • Akan dikelompokkan berdasarkan periode 10-tahunan
    • Dipilih secara random 10% dari setiap kelompok, dimana habit detail tidak kosong dan menggunakan Bahasa Inggris
  • Menyusun dataset (PIC: YAK):
    • Akan diperoleh sekitar 200 item
    • Nantinya akan direpresentasikan dalam bentuk graph/rdf, per-orang: 50 item
  • Mencari literature terkait metrik perbandingan graph/rdf/statement (ALL)
    • Untuk menentukan item yang mana lebih kaya dari dari item yang lain
    • Contoh: https://ontometrics.informatik.uni-rostock.de/wiki/index.php/Schema_Metrics
  • TODO:
    • Rekonsiliasi data: entitas, property, value

Pekan ke-3 September 2023

18 September 2023

• Peserta pasif diskusi WG interpolasi parallel

19 September 2023

• Diskusi pekanan PRSDI yang untuk pekan ini disajikan oleh KR NLP (Gambar 1)

Gambar 1. Sharing pekanan PRSDI

20 September 2023

• Diskusi dengan Julfa untuk
  • submisi laporan RP triwulan 3
  • rencana publikasi selanjutnya terkait korelasi data radiomic vs. dosis
• Diskusi WG artefak

21 September 2023

• Diskusi WG artefak (Gambar 2). Ringkasan dari diskusi hari ini adalah sbb:
  • Artefak:
    • Revisi definisi terminology, misal:
      • Open -> Accessible, No Prerequisites
      • Close -> Accessible, Prerequisites
      • None -> Not Accessible
    • Penggabungan kategori, misal:
      • Jika menggunakan software berbayar, maka masuk kategori “Not Accessible”
    • Mencermati nilai 0/1 yang “mencurigakan
  • Biodiversitas:
    • Pemodelan Data Property bisa dilakukan, tidak ada masalah berarti, hanya beberapa singkatan yang perlu diperjelas.
    • Lanjut ke pemodelan Object Property (relasi antar obyek/entity)
    • Menentukan dataset, jumlah data cukup besar, akan dilakukan sampling
    • Membuat statistik data (PIC:YAK)
      • Berdasarkan tahun
      • Berdasarkan kolektor
      • Berdasarkan species
      • Berdasarkan lokasi
    • Akan diputuskan dataset mana yang akan dipakai (termasuk metode sampling) berdasarkan hasil statistik data

Gambar 2. Diskusi WG artefak

22 September 2023

• Diskusi dengan Ibnu dan Julfa terkait implementasi LSTM dalam prediksi parameter rotasi bumi. Direncanakan untuk menyampaikan report tiap 2 pekan.

Pekan ke-2 September 2023

12 September 2023

• Webinar September PRSDI (Gambar 1)
• Diskusi LCA (Gambar 2). Saya dapat tugas latih data LCA, tapi blm tahu atribut yang digunakan dari data Agribalis kopi. Sedangkan targetnya adalah carbon footprint.
• Diskusi WG Artefak (Gambar 3). Berikut ringkasannya:
  • Artefak:
    • Restrukturisasi dataset: sparse matrix -> dense matrix
    • Fitur disederhanakan menjadi 3:
      • Code packaging, nilai: 1-5
      • Code repository, nilai: 1-4
      • Data, nilai 1-4
    • Topik difokuskan untuk memprediksi jumlah (kelompok) sitasi berdasarkan fitur diatas
    • TODO
      • Menyiapkan dataset contoh: 20 baris, 4 kolom (PIC: AAW)
    • Mempelajari algoritma selain decision tree (ALL)
  • Biodiversitas:
    • Mengganti dataset: “Habitat” ke “Habit Detail”
    • Topik difokuskan pada perbandingan deskripsi Habit Detail berdasarkan:
      • Tahun koleksi
      • Kolektor
      • Species/Lokasi/…
    • Metode analisis: menentukan entitas, properties dari setiap deskripsi Habit Detail spesimen
    • TODO:
      • Menyiapkan contoh deskripsi Habit Detail (PIC: AI)
      • Memodelkan deskripsi menggunakan metode diatas (ALL)

Gambar 1. Webinar PRSDI seri #7

Gambar 2. Diskusi LCA

Gambar 3. Diskusi WG Artefak

13 September 2023

• Diskusi dengan Julfa terkait revisi artikel IC3INA yang hasilnya sudah accepted tanggal 11 lalu.

Pekan ke-1 September 2023

4 September 2023

• Ke kampus. Untuk semester ini, senin akan saya kosongkan karena agendanya ‘ngamen’ di kampus.

5 September 2023

• Merapikan draft artikel Galih

6 September 2023

• Akhirnya artikel Galih bisa disumbit menjelang tengah malam

7-8 September 2023

• ASEAN-ROK AI Workshop di Jakarta. Bisa ketemua mas Tio (Gambar 1)
• Artikel Pebri bisa disubmit, tapi hanya untuk mendapatkan respon reviewer, bukan untuk serius disubmit

Gambar 1. Ketemu mas Tio

Pekan ke-5 Agustus 2023

28 Agustus 2023

• Ke kampus untuk diskusi RPS meski ujungnya menyelesaikan draft artikel karena teman2 sibuk bahas akreditasi

29 Agustus 2023

• Diskusi radiotherapy terkait rencana studi Julfa

30 Agustus 2023

• Diskusi WG artefak sebagai kelanjutan diskusi Jumat pekan kemarin

31 Agustus 2023

• Menyelesaikan draft artikel Galih untuk submisi IC3INA, ternyata masih diperpanjang hingga tanggal 7 September 2023

1 September 2023

• Diskusi dengan Pebri di kampus
• Memberikan materi matrikulasi

Pekan ke-4 Agustus 2023

22 Agustus 2023

• Diskusi pekanan PRSDI dengan pemateri dari HCIV
• Sosialisasi DBR dari FT-UGM (Mesin dan Elektro), dikoordinir oleh PRMC

23 Agustus 2023

• Iseng mengkonfigurasi mariaDB untuk persiapan ngamen. Beruntungnya saya ketemu pak Daryanto yang menyampaikan rencana diskusi muSR esok harinya.

24 Agustus 2023

• Diskusi muSR bareng tim pak Daryanto dan Watanabe san. Bisa diskusi juga dengan mas ZA (Zulkaida Akbar) terkait pekerjaan data science.
• Diskusi dengan timnya mas Putu terkait diterimanya CRP LoRaWAN. Saya diminta melakukan kajian literatur terkait potensi keamanan siber.

25 Agustus 2023

• Diskusi WG artefak
  • terkait dampak dibukanya code dan data terhadap tingkat sitasi
  • pemetaan biodiversitas ke habitat
• Ke kampus, diskusi dengan Pebri dan memberikan materi matrikulasi untuk mahasiswa baru.

Selebihnya (pekerjaan gak masuk akal)

• Drafting artikel:
  • Defunginya Galih: masih menunggu pengujian, krn sedang menjalankan skema 5 folds partisi
  • Produk manufakturnya Sastra: pengguna dataset yang sama sudah 14 yang muncul di scholar.google.com, agak susah jika tetap menggunakan dataset yg sama karena capaian periset sebelumnya agak mustahil dikejar, nyaris sempurna
  • Artikel INIS bu Anne: pengujian dengan XGBoost hanya 14%
  • Serangan DDoS dari NGINX logsnya Pebri: draft artikel sudah dikonversi ke overleaf

Pekan ke-2 Agustus 2023

7 Agustus 2023

• Uji coba model EfficientNet v2 dan berbagai variannya utk dataset ini. Sempat maju mundur karena dataset sejenis dan pengujian model terhadap dataset sejenis sudah sangat banyak. Pengujiannya juga tidak mulus karena mesin hitung yang kami gunakan praktis hanya google colab. Sementara mengunggah dataset ke drive harus dilakukan perlahan.

8 Agustus 2023

• Mengikuti webinar PRSDI yang kali ini disajikan oleh group IR terkait Small Medium Enterprise (SME) (Gambar 1)
• Drafting artikel untuk Julfa.

Gambar 1. Webinar PRSDI #6

9-11 Agustus 2023

• Fokus membereskan draft artikel IC3INA, meski akhirnya hanya artikel Julfa yang berhasil disumbit.

11 Agustus 2023

• Diskusi dengan pak Jarwo terkait tuning LDA topic modeling dan versi supervised-nya (BERTopic).

Pekan ke-1 Agustus 2023

31 Juli 2023

• Eksplorasi peluang publikasi untuk Julfa karena yang sebelumnya sudah penuh, praktis selalu ada jurnal baru yang bahkan dalam hitungan hari. Akhirnya, coba peluang ini. Ternyata dataset terbatas untuk undangan yang akan berkompetisi. Lalu ketemu artikel ini dan dataset ini. Karena artikelnya berbasis data citra (non dcm), saya terpikir untuk mengubah dataset dcm ke png. Dengan harapan melakukan aktifitas yang sama dengan data yang sedikit berbeda.

1 Agustus 2023

• Masih terkait dengan pergolakan pemikiran kemarin, sayapun terpikir untuk melakukan clustering untuk data berlabel seperti ini.
• Menyusun draft artikel terkait topic modeling untuk bahan diskusi hari Jumat.

2 Agustus 2023

• Diskusi dengan Julfa terkait tema publikasi. Sejauh ini ditemukan peluang untuk eksplorasi dataset ini. Kesimpulan ini diperoleh setelah melihat (sangat) banyak publikasi terkait di mana mereka menggunakan beberapa dataset dan perlu melakukan praproses untuk menyamakan ukuran dan melakukan augmentasi untuk memperbanyak data latih.
• Drafting artikel topic modeling, fokus hari ini adalah menyusun related works.

3 Agustus 2023

• Diskusi KRKC. Kira2 hasilnya akan seperti ini

4 Agustus 2023

• Diskusi topic modeling (hanya berdua bu Anne). Diputuskan untuk menggunakan pendekatan supervised karena datanya memang sudah berlabel. Hal ini disebabkan karena cukup sulit melakukan evaluasi.

Pekan ke-4 Juli 2023

24 Juli 2023

• Ke FT-UI mengantar istri wawancara program S3
• Membuat ringkasan terkait [1] setelah akhir pekan kemarin diskusi dengan Jan. Di referensi [1] tersebut saya mengenal beberapa istilah berikut
  • KMP (Key Measurement Point) yang merupakan tempat di mana material radioaktif dapat diukur. KMP sendiri terdiri dari KMP inventory (hasil pengukuran material radioaktif digunakan untuk menentukan inventory) dan KMP flow (hasil pengukuran material radioaktif digunakan untuk menentukan perubahan inventory).
  • Contoh dari kelompok flow pada KMP adalah bagian pengiriman, terminasi dan accidental loses. Karena contoh tersebut, KMP yang di mana material radioaktif hilang unintentionally dapat berubah menjadi KMP flow. Benar seperti itu? Silakan beri pendapat di kolom komentar (seperti youtuber).
  • Dalam kerangka blockchain, KMP flow yang mengalami accidental loses dan perubahan inventory dalam bentuk apapun pada material radioaktifnya akan mengajukan semacam notifikasi (yang harapannya diakui sebagai transaksi) kepada semua entitas dalam blockchain sebagai berkurangnya balance. Tentu saja, jika ada entitas yang unintentionally menemukan material radioaktif (dalam kondisi apapun), ia dapat memberikan notifikasi (yang harapannya juga dianggap transaksi blockchain) kepada entitas lain terkait karakteristiknya sebagai bertambahnya balance.
  • MBA (Material Balance Area) adalah tempat di mana balance dari material radioaktif dapat dibuat. Balance yang dimaksud di sini adalah neraca, semacam neraca keuangan. Sepertinya dapat disimpulkan bahwa MBA terkait erat dengan KMP, bahkan sangat boleh jadi sama.
  • SLUMBAT pada [1] dikembangkan menggunakan [2] yang kode sumbernya dirawat di sini.

25 Juli 2023

• Mengikuti webinar PRSDI ke-4 dengan tema seperti pada Gambar 1
• Mendampingi Julfa dalam wawancara peserta program DBR dilanjutkan dengan diskusi untuk menanggapi hasil wawancara. Hal ini juga dimaksudkan untuk melengkapi bahan penyusunan makalah conference untuk Julfa. Beberapa artikel menarik untuk dijadikan referensi adalah [1], [2], [3], [4], [5]

Gambar 1. Webinar ke-4 PRSDI

26 Juli 2023

• Mencoba script swin transformer (versi TF) dari Julfa di pc, tetapi dijalankan secara remote (masih di LAN yang sama dengan petunjuk di sini).
  • Perlu dilakukan tambahan konfigurasi seperti petunjuk di sini dan perintah sudo echo 0 | sudo tee -a /sys/bus/pci/devices/0000\:00\:00.0/numa_node harus dijalankan setiap kali GPU akan digunakan untuk menghitung.
  • Karena itu, sy buat script yang akan otomatis dijalankan ketika pc booting dengan petunjuk ini. Sebagai catatan, perintah tersebut sangat terkait dengan kondisi pc saya ketika tulisan ini dibuat.
  • Selain itu, perlu dibuat symbolic link dari /usr/lib/cuda ke /usr/local
• Mempelajari swin transformer (versi Pth) dari Galih, ternyata semua dikemas dalam paket timm.

27 Juli 2023

• Diskusi KR KC
• Eksperimen dengan script Julfa, yang hanya mengandalkan CNN, diperoleh akurasi 84% dengan 50 epoch, tapi loss kurang lebih sama. Eksperimen dilakukan di pc dengan modal GTX980i.

28 Juli 2023

• Eksperimen DeFungi dengan script Galih. Setelah gagal dilakukan di pc, akhirnya semua dinaikkan ke drive google. Hasil pengujian menunjukkan akurasi 96%.
• Siangnya diskusi dengan Pebri. Ybs sharing rencana untuk lanjut kuliah, sehingga saya menyarankan untuk ikut aturan main akademis, publikasi. Yang menjadikan diskusinya lama justru kondisi kampus. Lama-lama saya berpikir kondisi kampus seperti kondisi perpolitikan negeri ini, he3…
• Tugas plotting data akhirnya selesai (Gambar 2) setelah berbagai tantangan seperti membalik nilai koordinat sumbu-x, mendeteksi puncak negatif (titik balik), dan menyertakan tulisan di wilayah plot.

Gambar 2. Tugas plotting